特提斯成矿作用研究室
特提斯成矿作用研究室定位于解决特提斯域，特别是青藏高原隆升诱发的资源与环境效应及技术支撑平台和科技创新平台，致力于开发地球系统科学前沿分析技术方法，服务于青藏高原及周边新生代环境系统和关键金属成矿系统的演化过程研究。
研究室主要负责的是同位素地球化学实验室的建设、运行和管理，该实验室已经初步完成激光烧蚀电感耦合等离子质谱仪测年实验室平台和团队建设。实验室团队利用现有的激光剥蚀等离子质谱仪（LA-ICP-MS），初步开发了锆石U-Pb定年技术，为云南省首家拥有该项技术的地球化学实验室。同时，实验室即将引进多接收等离子质谱仪（MC-ICP-MS）和高分辨等离子质谱仪（MC-ICP-MS），为后续开展同位素物源示踪（Hf、Ti、Mo）和副矿物/碳酸盐高精度定年奠定基础。
青藏高原地质研究室
青藏高原地质研究室以青藏高原为天然实验室，借助云南区位优势，瞄准国际前沿重大科学问题，开展与青藏高原形成演化有关的地表过程和气候环境效应研究，力争取得原创性、创新性重大研究成果。
研究室现配备大量仪器设备，能够满足年代学、磁性地层学、岩石学、古地貌方面的研究，同时已建成专业的地质样品库，方便样品的科学管理和使用。年代学方面，研究室成员参与同位素地球化学实验室的建设，包括剥蚀等离子质谱仪（LA-ICP-MS）、多接收等离子质谱（MC-ICP-MS）和高分辨等离子质谱仪（MC-ICP-MS）的调试和运行，利用上述仪器开展青藏高原地质演化的年代学研究，建立高精度年代格架。磁性地层学方面，研究室现配备齐全的古地磁研究设备和工具，包括古地磁样品专用双刀切样机（S1-220）、古地磁取样钻机（品钻 DC382）和岩芯切割机（Core Splitter）等，能够满足磁性地层研究中所需的野外样品采集和前处理。岩石学方面，研究室配备了多样的切割机、研磨机和显微镜，能够进行岩石薄片、光片的磨制和镜下观察。已建成运行的场发射扫描电子显微镜（Quattro S）和激光粒度分析仪（马尔文Mastersizer 3000）可以分别开展岩石碎屑颗粒显微形貌观察与拍照及粒度和沉积环境分析。地貌方面，研究室拥有塔式图形工作站和航拍无人机，通过将无人机飞行数据经工作站处理后，能够精准恢复研究区三维地貌模型，为地表地质过程研究提供支撑。
高原湖泊环境研究室
高原湖泊环境研究室瞄准高原湖泊生态环境演变与调控这一国家重大关切，以青藏-云贵高原湖泊为切入点，建设地球系统科学综合观测研究平台，开展全球变化背景下湖泊生态环境保护与调控，拟解决高原湖泊演化的历史、过程、变化趋势和机理等问题，揭示气候与人类活动双重驱动下的湖泊环境演化过程，为现代和未来高原湖泊水环境调控提供科学的数据支撑。
高原湖泊环境研究室设计建设高原湖泊沉积环境与全球变化实验室，包括2台稳定同位素质谱仪及其附属设备的多同位素测试分析平台。主要用于开展高原湖泊（包括河流）表生环境下C、N、O、H等元素的生物地球化学循环和环境变化过程的同位素变化机制研究工作，此外计划开展了长链烯酮、GDGT等有机生物标记物的生物地球化学研究。在未来的研究中，明确指示湖泊、风尘沉积等地质体的温度和降水变化的定量新指标，如GDGTs、Δ47、长链烯酮和单体氢同位素等；加强高原湖泊物源变化的多指标综合研究，探讨与之相关的气候环境变化机理；探究云贵高原、青藏高原以及中国西北干旱、半干旱区生态系统中碳、氮循环过程的同位素变化机制，评价自然和人类活动对这些区域生态环境的影响。培养一支既包涵熟悉有机化合物和稳定同位素分析方法的实验技术人员，同时又有开展湖泊、土壤等表生环境生物标志物和同位素地球化学机制研究人员的综合研究团队。
古植物与陆地生态系统研究室
古植物与陆地生态系统研究室目前已建成光学显微镜成像实验室、标本化学处理实验室、标本修理与制片实验室和扫描电子显微镜实验室，是我国目前最先进的古植物与陆地生态系统研究实验室之一。
光学显微镜成像实验室分大化石标本照相室及化石显微成像室。标本照相室配备有进口精修设备、Canon 1DX 高端照相机、德国原装进口翻拍设备2套，可对大化石样品进行宏观形貌拍照。化石显微成像室配备德国莱卡研究级生物、体视全自动荧光显微成像系统各1套、德国蔡司研究级生物、体视全自动荧光显微成像系统各1套、研究级偏光显微镜及显微光度计、傅里叶红外显微成像系统、超景深显微成像系统、长臂显微镜、双人共览显微镜、常规生物显微镜、常规体视显微镜等。
标本化学处理实验室，包括前处理实验室、酸泡实验室和后处理实验室，总占地面积100余平方米。配备有钢木结构实验台柜、PP材质的实验台柜、PP结构通风柜体、环氧树脂中央台面、全防护的酸储存柜、PP通风系统、酸废气废液处理系统等。
标本修理与制片实验室配备有全套的标本切割、磨制、修理和制薄片设备。建设有大型样品前处理室、切片实验室和制片实验室，占地面积50余平方米。分别配备有大型国产数控切割机床、德国Wire-Tec 金刚石线切片机、美国标乐（Buehler）薄截面精密切割机、美国标乐（Buehler）线性高精度切割机、德国徕卡轮转式切片机、德国徕卡手摇式切片机、国产小型精密切片机、国产可控速式磨片机、国产大型切片机、进口温控加热箱、国产钢木结构通风橱等。可对不同结构、大小的岩石样品、化石样品进行精密切割并制作岩石、化石光学薄片，同时也可进行化石揭片实验处理。
微结构扫描电子显微镜实验室配备了先进的环境扫描电子显微镜，可在低真空状态下直接检测非导电导热样品。对于生物样品、含水样品、含油样品，既不需要脱水，也不必进行喷碳或金等导电处理，可在自然的状态下直接观察二次电子图像并分析元素成分。同时配备了镀膜仪、能谱仪、阴极发光仪等设备，能够满足不同实验成像的需求。
科技与地质考古研究室
科技与地质考古研究室瞄准全球变化领域和考古学共同关注的前沿和热点问题，针对青藏高原东南缘（云南高原、东南亚地区）这一关键区域，开展人类演化发展与环境变化之间的关系研究，拟解决早期人类活动、人群迁移与环境变迁的耦合关系等问题，揭示人类演化过程及其对环境的适应方式和策略，为云南史前“人地关系”的变化过程和机制研究提供科学依据，服务国家“一带一路”文化建设。
研究室现已建成微体古生物与地球化学前处理实验室、微体古生物显微鉴定实验室、激光粒度与沉积学实验室，配备大量仪器设备，通过植物大化石（种子遗存、木炭化石）、微体古生物（孢粉、植硅体、淀粉粒、硅藻、有孔虫）及古环境替代指标（粒度、色度、磁化率、粘土矿物、总有机碳）的综合分析，能够满足古植物学、古生态学、古环境学等方面的研究。植物大化石方面，配备有一台Leica体视显微镜，可用于微体化石的鉴定与测量。微体古生物与环境替代指标分析方面，配备有Mili-Q IX 7005纯色系统 1台、湘仪医用离心机2台、烘箱2台、真空冷冻干燥机1台、数显恒温水浴锅（KTC-B1-T）2台、石墨电热板7个、KH-500(50B)型超声波清洗器3台、Vmax振荡器1台、800-1小型离心机2台、混合仪（SciloGex/ Vortex QL-861）2台、冰柜/冰箱2台、电子（分析）天平4台、通风橱2个等仪器设备，能够完全满足微体古生物与地球化学前处理分析实验。同时，配备有生物显微镜（Leica/Nikon及成像系统）3台、偏光显微镜（Leica/Nikon）2台、Matersizer-3000 粒度分析仪、MS-2B型磁化率仪、CR-700R分光色度仪等仪器设备，能够完全满足微体古生物鉴定分析以及部分环境指标测定需求。
年代学研究室
年代学研究室主要针对晚新生代地质历史时期构造地质和古环境事件开展年代学研究，现已初步建立了电子自旋共振（ESR）和宇宙成因核素两个年代实验室。
重点实验室ESR测年实验室于2020年11月底购置了德国Bruker公司最新的ESR5000型X波段电子顺磁共振波谱仪。这是目前国内大学和科研院所中引进的首台该型号机型，可以实现对地质矿物和化石等不同类型样品的液氮低温和常温测量，与大多数早期机型相比，购置的电子顺磁共振波谱仪可以实现样品的全自动化角度旋转和进样测试，大大提高了ESR信号测量的可重复性和测试分析精度。目前新购置的ESR谱仪已完成安装和调试工作，设备的信噪比、分辨率和稳定性等技术指标都优于样品测试的所需的性能要求。2021年度在省重点实验室经费条件允许的前提下，ESR实验室还将购置一台NaI探头室内Gamma能谱仪用于地质样品剂量率的测试，通过ESR波谱仪和拟购置的Gamma能谱仪获得的分析数据，本实验室将可以独立完成ESR测年所需的全部测试分析工作，为本校及其他相关科研单位提供年代测定服务。
此外，地质年代学实验室中的宇宙成因核素测年实验室部分，目前已完成矿物提纯部分的实验建设，提纯后的石英矿物Al含量可以达到大型加速器质谱（AMS）的测试要求。